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我院召开泥鳅基因组学和生物技术的国际研讨会

日期:2025-12-06作者: 审核人: 浏览量:

2025年12月3日至4日,泥鳅基因组学和生物技术的国际研讨会在我校水产楼A105天辰报告厅举行,本次会议围绕“泥鳅基础生物学与创新生物技术助力水产养殖可持续发展”主题展开。会议邀请了俄罗斯莫斯科国立大学、捷克科学院、奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学、韩国梨花女子大学、京都大学、近畿大学、北海道大学、东京农业大学、水生生物保护协会、渔业研究与教育组织和华中农业大学11所高校和协会的28位学者进行主题报告。

12月3日研讨会伊始,华中农业大学水产学院Katsutoshi ARAI教授致开幕词,向参会学者表示欢迎。他介绍了本次研讨会旨在搭建欧亚学术交流桥梁、推动泥鳅研究与产业融合的核心目标。他提到:“近20年全基因组测序等新技术让泥鳅研究取得了突破性进展,但欧亚学者间的协作仍有不足,希望本次会议能成为整合基础研究与产业应用的纽带。”

Katsutoshi ARAI教授致开幕词


缅怀先驱,传承学术精神

俄罗斯莫斯科国立大学Ekaterina VASIL'EVA教授带领参会师生一同追忆杰出鱼类学家Victor VASIL'EVA教授的学术生涯。Victor VASIL'EVA教授在鳅科鱼类中首次发现了克隆-两性生殖方式,以及二倍体-多倍体复合体,证实了自然过程可形成克隆系及杂交起源的二倍体、多倍体新物种;并确立“开放式网状物种形成”是鱼类、两栖类、爬行类等亲缘关系较远动物类群共有的关键进化事件。他的著作《鱼类进化核型学》系统涵盖了鱼类染色体核型进化领域的核心成果,为鱼类进化研究奠定了重要基础。

Ekaterina VASIL'EVA教授缅怀Victor Vasil'ev教授

随后,捷克科学院Karel JANKO研究员缅怀了杰出鱼类细胞遗传学与进化生物学家Petr RÁB教授。Petr RÁB教授深耕鱼类核型演化、物种形成等领域四十余年,成果涵盖185篇论文与多部著作。他深入研究了杂交不育相关基因在生殖隔离中的作用,还探索了杂交克隆与基因组分化的关联,推动了物种概念的拓展,让学界对“物种”的定义纳入了更多有性生殖相关的特征。

Karel JANKO研究员缅怀Petr RÁB教授

前沿研究赋能,深耕基因组资源与可持续发展

在学术报告环节,奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学Alicia BOROŃ教授作了题为“波兰鳅科鱼类杂交与多倍化的染色体及生物学特性”的报告。BOROŃ教授展示了当地泥鳅种群的详细调查数据,发现波兰泥鳅种群以三倍体杂交雌性为主,与二倍体(如Cobitis taenia、C. elongatoides)共存,四倍体占比仅4%-6%。其研究通过染色体图谱分析证实,C. taeniaC. elongatoides的rDNA位点具有物种特异性,5S rDNA可作为可靠的细胞遗传标记,能有效区分二倍体杂交种和异源多倍体复合体,且F1代杂交种不遵循孟德尔遗传,不存在核仁优势现象。

Alicia BOROŃ教授作报告

奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学的Dorota JUCHNO副教授作了题为“三倍体泥鳅雌性的繁殖潜力:克隆与有性繁殖及温度的作用”的报告。Dorota JUCHNO副教授介绍了繁殖特性与温度影响的细节。波兰泥鳅的产卵期集中在6-7月,她观察到三倍体雌性的产卵期长于二倍体,且产卵周期内可产卵三次,卵巢中存在各阶段卵母细胞。她指出三倍体雌性的卵子不仅能通过雌核发育进行克隆繁殖,还能整合精子基因组形成四倍体,但四倍体雄性不育,精子发生会停滞于早期阶段。温度对发育的影响也很显著,18℃时不同母本基因组的胚胎发育成功率差异明显,在10%-30%之间,28℃时整体发育成功率下降,且三倍体和四倍体幼体存在脊柱弯曲、无胸鳍等畸形,畸形与基因组组成、温度均有密切关联。

Dorota JUCHNO副教授作报告

奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学的助理教授Olga JABŁOŃSKA作了题为“四倍体鱼类:温度与母本基因组独立的后代形成及精巢生理研究”的报告。她聚焦鳅科鱼类杂交多倍化相关研究,发现四倍体鱼类孵化初期三倍体比例较高,后期显著下降,且高温会加速这一比例的衰减过程。其研究显示,四倍体雄性精巢中的雄激素受体表达降低,但激素信号通路正常,基于此提出自噬可能参与生殖系统维持的假说,相关功能基因正处于验证阶段。

Olga JABŁOŃSKA作报告

演化与基因组:从地理驱动到分子机制

韩国梨花女子大学的Yong-Jin WON教授作了题为“韩国泥鳅的演化历史:从地质与古水文驱动的物种形成到人为介导的杂交”的报告。Yong-Jin WON教授解析了地理因素对物种分化的作用。介绍了韩国三面环海且有山脉阻隔,地理隔离显著影响了淡水鱼类演化,长白山天池至太白山一线形成了南北地理边界,导致鱼类物种呈现明显的区域分布差异,目前共识别出16个鱼类物种。他表示冰川期海平面周期性变化改变了韩国、中国、日本间的海岸线及古河流格局,形成了陆桥与古河流,促进了物种扩散与二次接触,比如C. nalbanti就存在从南方向北方的扩张模式,Tamjin河种群还与日本九州鳅属物种存在跨海峡基因渐渗,证实了历史上的河流连通性。

Yong-Jin WON教授作报告

韩国梨花女子大学Ajit Kumar PATRA研究员作了题为“泥鳅属物种结构与演化分化的基因组洞察” 的报告。他展示了基因组分析的成果。通过种群基因组分析,发现Iksokemia属姐妹物种的形态分化有限,Seomjin河与Yeongsan河种群的遗传聚类相近,而Tamjin河及附近岛屿种群形成了独特的遗传群。完成了C. hankugensis的基因组测序,揭示其扩张的基因家族涉及核小体组装、脂质代谢等功能,这些结果为物种划分提供了新的分子证据。

Ajit Kumar PATRA研究员作报告

韩国梨花女子大学的Da-Song CHOI博士生作了题为“韩国南部半岛两种淡水泥鳅(Iksokemia hugowolfeldiI. longicorpa)的种群基因组学的报告。她介绍了遗传结构的特征。基于25个地方群体的PCA分析未发现明显的种群分离,中间种群形成于两大河流之间,有效种群规模较大且存在增长阶段,这可能与河流系统扩张相关。还发现模式产地种群的遗传聚类紧密,Tamjin河种群的遗传分化明显,说明形态学特征难以有效区分这些物种,需要结合基因组与地理证据才能准确划分。

Da-Song CHOI博士生作报告

从物种形成连续体到网状演化—杂交、无性与倍性动态如何重塑鳅科多样性

捷克科学院的讲师Karel JANKO作了题为“从物种形成连续体到网状演化—杂交、无性与倍性动态如何重塑鳅科多样性”的报告。他指出鳅科染色体结构与调控变异与无性繁殖、多倍化密切相关。在多个接触带中,亲本种分化程度可预测杂交后代形成有性重组群体或通过减数分裂前基因组内复制产生克隆配子。他提出两点新认识:一是在稳定克隆谱系内,两套亲本基因组并非静止,会发生可检测的基因转换与重组,导致杂合性逐渐丢失;二是生殖路径具有“剂量依赖性”,相同亲本基因组可因倍性平衡差异产生二倍体克隆或三倍体有性个体,这种“切换”为克隆体与亲本种间提供了短暂的等位基因交换窗口,形成非孟德尔式渐渗模式,最终构成网状演化格局。他建议建立协同研究框架,将网状演化历史纳入物种界定与比较基因组学研究。

Karel JANKO作报告

鳅超科染色体水平基因组装揭示广泛的染色体内变异与稳定的共线结构

捷克科学院的Vladimir TRIFONOV研究员作了题为“鳅超科染色体水平基因组装揭示广泛的染色体内变异与稳定的共线结构”的报告。Vladimir TRIFONOV研究员指出鳅科在鲤形目中具有丰富的结构基因组变异,这可能是物种形成的重要机制。染色体级别组装可通过特异性探针验证,这些探针是研究减数分裂同源互作的关键工具。卫星DNA簇在鲤形目中保守且具染色体特异性,但着丝粒功能相关重复序列演化迅速。高质量染色体组装对阐明鳅类独特生殖策略的分子机制至关重要。

Vladimir TRIFONOV研究员作报告

杂交扰乱减数分裂:鳅属杂交种克隆性与不育性的制约因素与前提条件

捷克科学院的Anatolie MARTA研究员作了题为“杂交扰乱减数分裂:鳅属杂交种克隆性与不育性的制约因素与前提条件” 的报告。Anatolie MARTA研究员向讲述了当分歧物种杂交时,基因组不亲和会导致减数分裂、基因表达和染色体配对出现系统性错误。随着世代推移,这些不亲和性不断积累,最终造成广泛的减数分裂失败和不育。他指出,部分杂交个体可通过不同机制产生未减数的配体;在特定接触区内,这种配子发生异常可能被正向选择。当两种关键异常在杂交群体中被固定—即配子发生中的基因组加倍和雌核发育(激活后剔除父本基因组)—便可能形成稳定的克隆谱系。一旦繁殖方式完全转为克隆,这些杂交个体就与双亲本及有性杂交个体形成即时且强烈的生殖隔离。他揭示了初级杂交虽可自发产生克隆性配子发生,但雌核发育的固定极为罕见,需与亲本长期共存并反复杂交方可实现。鳅属因此成为解析如何塑造脊椎动物无性起源的关键模型。

Anatolie MARTA研究员作报告

基于染色体水平基因组揭示快速演化中鳅属的性染色体演化与动态

捷克科学院的Lucija ANDJEL博士生作了题为“基于染色体水平基因组揭示快速演化中鳅属的性染色体演化与动态” 的报告。Lucija ANDJEL博士介绍了自己研究中构建了三个亲本种(C. elongatoidesC. taeniaC. tanaitica)的高质量染色体水平基因组,这些亲本可产生多种无性杂交后代。她指出C. elongatoides 染色体1(Cho1a)呈典型XY分化。C. taenia 染色体5(Cho5)有年轻Y连锁区。C. tanaitica 染色体6(Cho6)存在中等分化区,提示性染色体处于中间演化阶段。针对性别连锁位点设计的PCR引物可准确区分雌雄基因型,并在分化区内鉴定出多个性别决定候选基因。这揭示了该类群存在不同且非同源的性染色体系统,表明性别决定机制快速更替。在杂交种中,性别决定通路出现偏离,提示杂交基因组干扰性别决定。

Lucija ANDJEL博士生作报告

鳅类的起源与多样性

水生生物保护协会的董事会主席Kenji SAITOH作了题为“鳅类的起源与多样性” 的报告。Kenji SAITOH他指出鳅类占鲤形目物种总数的1/3,是最大的淡水鱼类群。东亚鳅科鱼类在流域内呈现体型与卵径的梯度:栖息于温暖泛滥平原的种类体型与卵均较小,而生活在寒冷急流中的种类体型与卵较大。细胞进化趋势在鳅亚科、条鳅亚科与鳅科中相似:祖先核型可能为2n=50,通过臂内倒位逐渐演变为中部着丝粒染色体。其中鳅亚科存在两支:南亚类群为四倍体,东亚类群为二倍体。日本四倍体鳅包括异源与同源四倍体,而温带欧亚大陆则是种间杂交导致多倍化的早期发生地。泥鳅属情况相反,且高度多样的条鳅亚科与爬鳅亚科至今无多倍体报道。因此,鳅类是研究“多倍化—无性进化”与“非多倍化”两类模式的理想模型。

Kenji SAITOH作报告

日本多倍体鳅属的起源

京都大学的硕士研究生Yugo MIUCHI作了题为“日本多倍体鳅属的起源” 的报告。Yugo MIUCHI通过分析其群体遗传结构与复杂的杂交历史,推断四倍体种的系统发生起源。利用MlG-seq方法,对采自日本约150条河流的14种拟鳅进行了全基因组SNP检测。基于SNP的系统发生分析识别出主要支系,多次杂交证明四倍体物种的候选亲本同时来自striata和biwae两大复合种组。这表明四倍体种经历了不同复合种组间的杂交,而在单一支系内部未发现因杂交导致的基因组加倍证据,多倍化可能由中等远缘类群间的杂交驱动。

Yugo MIUCHI作报告


日本异源四倍体鳅“大和”复合种不同染色体族之间系统发生关系与交配后隔离

近畿大学的硕士研究生Hayato OKA作了题为“日本异源四倍体鳅“大和”复合种不同染色体族之间系统发生关系与交配后隔离” 的报告。Hayato OKA介绍了“大和”鳅是由两个二倍体鳅(2n = 48 和 50)杂交形成的异源四倍体类群。部分群体染色体数为98 条,其他群体染色体数目呈现递减(94、92、90、86、82 和 80),表明该鳅正经历再二倍化。人工杂交实验及对 F₁ 雄性的组织学观察发现,亲本染色体数目差异越大,其子代精细胞或精子数量趋于减少。这揭示了再二倍化过程中的染色体分化促进了大和刺鳅的交配后隔离。

Hayato OKA作报告

日本北鳅属(条鳅科)

京都大学的Yuta KATAYAMA博士生作了题为“日本北鳅属(条鳅科)” 的报告。Yuta KATAYAMA博士讲述了全球条鳅科概况和北鳅属的分布情况。并提出日本北鳅属表现出丰富的形态与生态多样性、生境范围从静水到河源,以及具有出本地适应性。他表明环境与生境异质性会驱动日本北鳅属多次分化。日本北鳅属线粒体DNA和核DNA不一致表明存在历史上的基因混入现象。日本北鳅属共同的形态但不同的遗传学表明存在平行进化。

Yuta KATAYAMA博士生作报告


俄罗斯亚洲地区及邻近区域鳅科研究现状

12月4日,俄罗斯莫斯科国立大学的Ekaterina VASIL'EVA教授率先作了题为“俄罗斯亚洲地区及邻近区域鳅科研究现状”的报告。其团队系统梳理了俄罗斯亚洲部分及蒙古、哈萨克斯坦等周边地区鳅科物种的分布数据,结合分子测序技术更新了3个亚种的分类界定,为欧亚大陆鳅科演化谱系研究提供了关键拼图。




Ekaterina VASIL'EVA教授作报告

日本隐秘泥鳅

近畿大学的Tadao KITAGAWA教授和硕士研究生Keigo KUNIEDA分别作了题为“日本泥鳅属中‘隐秘泥鳅’的真实特征”和“本州岛中部‘空白区’发现泥鳅属的‘隐秘泥鳅’种群”的报告。他们通过形态学与基因组学结合的方法,首次明确了本州岛中部“空白区域”新种群的遗传分化特征,修正了学界对该物种栖息地的传统认知。

Tadao KITAGAWA教授作报告

Keigo KUNIEDA作报告




Fgf8 介导外鳃形成,助力鱼类登陆过渡

华中农业大学的孙兵博士后作了题为“Fgf8 介导外鳃形成,助力鱼类登陆过渡”的报告。孙兵博士后聚焦于一个关键演化问题:古代鱼类在肺部功能尚未完善前,如何在低氧水域中存活?通过比较塞内加尔多鳍鱼、非洲肺鱼、泥鳅和青蛙等模型。发现:外鳃发育程序在脊椎动物中高度保守、Fgf8是驱动外鳃新生的关键基因、以及外鳃为演化特征,并非直接源自无颌祖先。首次在鳅科鱼类中验证了该基因对脊椎动物“从水到陆”过渡性状的调控作用,为演化生物学提供了新模型。

孙兵博士后作报告

泥鳅的物种特异性晶状体再生及其调控机制和性染色体鉴定与性别标记开发

华中农业大学的硕士研究生郑宇轩和常雯琦分别作了题为“泥鳅的物种特异性晶状体再生及其调控机制”和“泥鳅的性染色体鉴定与性别标记开发”的报告。常雯琦通过基因组分析,首次将泥鳅性染色体定位于第20号染色体,并开发出准确率达100%的性别鉴定标记,为性别控制育种提供了关键工具。郑宇轩研究发现,晶状体再生能力具有系统发育特异性,仅在鳅亚科(尤其泥鳅)中存在,且受BMP4通路保守调控。该研究为脊椎动物眼再生提供了新的鱼类模型。这两项研究分别为泥鳅性别机制解析和再生生物学提供了新靶点与理论基础。

郑宇轩作报告

常雯琦作报告




以鳅科鱼类为起点的生殖细胞移植边界初探

华中农业大学的梅熠辉博士生作了题为“以鳅科鱼类为起点的生殖细胞移植边界初探”的报告。以杂交三倍体泥鳅为受体,分别移植了大鳞副泥鳅(同亚科)和长薄鳅(跨亚科)的精原细胞。结果发现,尽管移植后受体精巢内均出现含供体DNA的精子,但只有遗传距离较近的大鳞副泥鳅精子功能正常,长薄鳅的精子则功能异常。这表明,生殖细胞移植的成功分化受到供、受体间遗传距离的制约。这拓展了鳅科作为模式生物在生殖工程领域的应用场景。

梅熠辉作报告

生殖细胞特异性基因组组成驱动克隆配子产生

北海道大学的Takafumi FUJIMOTO教授分别作了题为“生殖细胞特异性基因组组成驱动克隆配子产生”和“转录组学解析克隆泥鳅基因组加倍的分子基础”的报告,分享了其团队在泥鳅生殖机制方面和克隆泥鳅基因组加倍的细胞应答机制的最新研究。Takafumi FUJIMOTO教授通过染色体组操作诱导产生了双二倍体、同源三倍体、二倍体杂交种和异源三倍体等不同基因组构成的生物。这些构成显著影响生物的存活与繁殖能力:部分杂交个体会出现发育缺陷或减数分裂停滞,但在特殊机制下,也能产生未减数的克隆配子。此外,他的团队探索了单倍体生殖细胞的应用潜力,通过紫外线使卵子失活,再与四倍体杂交雄性的精子受精,成功诱导了雄核发育。

在基因组加倍机制研究中,Takafumi FUJIMOTO教授通过转录组分析表明克隆泥鳅通过减数分裂前核内复制产生二倍体卵。而其卵原细胞与野生型存在显著差异,即细胞周期通路关键基因普遍下调,黏连蛋白与DNA损伤检查点基因则显著上调。他指出克隆泥鳅可能通过抑制或跳过M期实现基因组加倍,相关通路上调则是维持基因组完整性的保护机制。这从分子层面阐明了克隆泥鳅基因组加倍的细胞应答机制。Takafumi FUJIMOTO教授的研究深入解析了泥鳅特殊的生殖机制,为水产动物的品种创新与遗传育种提供了新的技术路径和科学依据。

Takafumi FUJIMOTO教授作报告

利用细胞遗传标记估算泥鳅无性繁殖的起源

渔业研究与教育组织的研究科学家Kiko SHIBATA作了题为“利用细胞遗传标记估算泥鳅无性繁殖的起源” 的报告。通过细胞遗传学技术揭示了日本“克隆泥鳅”的起源之谜。她指出克隆泥鳅的基因组包含A和B两种类型,表明其起源于远古杂交。然而,利用现存的两个种群杂交却无法复制该特征,暗示其祖先与现存种群已发生遗传分化。她的团队通过开发5S rDNA探针和新型重复序列探针(如M407)进行原位杂交分析,发现克隆泥鳅携带的祖先A’基因组与现存A种群存在显著差异。通过杂交与PCR验证,成功分离并鉴定了具有A’特异性标记的后代。这证实克隆泥鳅并非源自现存种群的杂交,为理解脊椎动物无性繁殖的进化提供了新视角,也为泥鳅遗传育种与保护奠定了分子基础。

Kiko SHIBATA作报告

缺陷性减数分裂构型导致克隆三倍体及杂交泥鳅雄性不育

东京农业大学的Masamichi KURODA副教授作了题为“缺陷性减数分裂构型导致克隆三倍体及杂交泥鳅雄性不育”的报告,揭示了导致杂交与三倍体泥鳅雄性不育的细胞遗传学机制。他介绍了日本北海道网走川流域存在遗传分化的A、B两大种群,克隆三倍体泥鳅由二倍体克隆个体的未减数配子与单倍体精子结合形成。通过原位杂交分析发现,三倍体雄性(AAB基因型)在减数分裂中出现严重染色体配对异常,A-A配对效率低,A-B配对紊乱并常形成三价体,导致精子形态异常、倍性混乱,最终造成完全不育。通过实验进一步证实,人工杂交产生的雄性后代同样不育,表明基因组差异引发的减数分裂缺陷是雄性不育的关键原因。这为理解多倍体与杂交生殖障碍提供了典型案例,并为水产遗传改良提供了理论依据。

Masamichi KURODA副教授作报告

基于 espl1 杂合敲除干扰精原细胞有丝分裂姐妹染色单体分离诱导鱼类多倍体形成

华中农业大学的曹小娟教授作了题为“基于 espl1 杂合敲除干扰精原细胞有丝分裂姐妹染色单体分离诱导鱼类多倍体形成”的报告。研究瞄准了水产养殖中三倍体鱼类的产业需求,致力于突破人工同源四倍体创制的技术瓶颈。团队以天然存在多倍体类型的泥鳅为模型,完成了高质量基因组组装,并锁定在配子形成中高表达的espl1基因。曹小娟教授团队证实了espl1杂合突变雄鱼与野生型雌鱼杂交,能高效产生三倍体后代,并能通过三倍体桥产生可育四倍体,实现了通过干扰精原细胞有丝分裂来创制多倍体的新路径。此外,还揭示了cdk1缺陷触发精原细胞内复制、进而形成未减数精子的分子机制。这建立了一套高效的多倍体创制方法,为鱼类三倍体育种提供了新的核心技术,对推动产业提质增效具有重要意义。

曹小娟教授作报告

spo11基因敲除型斑马鱼导致未减数卵子的产生及其在多倍体育种中的应用

华中农业大学的黄钰微博士生作了题为“spo11基因敲除型斑马鱼导致未减数卵子的产生及其在多倍体育种中的应用”的报告。研究针对当前化学诱导和远缘杂交等技术在培育多倍体鱼类中存在的瓶颈,从减数分裂缺陷入手。黄钰微博士的团队发现,敲除高度保守的 spo11 基因可导致斑马鱼减数分裂异常,成功诱导雌鱼产生未减数卵子(2N),而雄鱼则不育。利用这些未减数卵进行杂交,团队成功获得三倍体后代,验证了该路径在多倍体创制中的可行性。该方法为高效、定向培育多倍体水产养殖品种提供了新的技术思路。

黄钰微博士生作报告

cdk1 基因敲除对热休克诱导泥鳅多倍化的影响

华中农业大学的姜汉军博士生作了题为“cdk1 基因敲除对热休克诱导泥鳅多倍化的影响”的报告。姜汉军博士针对鱼类多倍体育种中诱导率低的技术瓶颈,以泥鳅为模型,首先优化了热休克诱导方案,使四倍体诱导率达44%。他指出敲除cdk1基因可大幅提升诱导效率,在cdk1突变体胚胎中,四倍体诱导率最高可达60%。cdk1缺失会上调周期蛋白基因,并抑制分离酶基因 espl1 的表达,可能通过影响黏连蛋白降解与染色体分离,从而促进染色体加倍。此外,cdk1突变体能产生二倍体精子,为多倍体育种提供了新的种质资源。这揭示了cdk1基因在热休克诱导多倍化中的关键调控机制,为建立基因编辑与物理诱导相结合的精准育种技术提供了新策略。

姜汉军博士生作报告

最后,华中农业大学的曹小娟教授对会议进行了总结。她再次感谢各位远道而来的嘉宾在华中农业大学呈现了一场场精彩纷呈的学术报告。曹小娟教授总结指出,本次会议围绕鳅类进化、生殖机制、分子调控与技术应用等多方面展现了前沿进展与交叉融合趋势。各国团队所分享的创新方法与成果,为领域关键问题提供了新的解决思路。她强调,未来需深化国际合作,进一步解析鳅类独特的生物学特性,推动相关成果向水产养殖与生物多样性保护等领域转化,助力产业高质量发展。本次研讨会成功搭建了全球鳅类研究的交流平台,为该领域的创新发展凝聚了共识、明确了方向。

曹小娟教授作总结





文字编辑:姚营新、谈慧敏、瞿昊、许义芳、姜雨鑫、黄钰微

供图:研究生会网络传媒中心全体成员

审核人:熊晓磊、曹小娟